教室によって料金設定が異なります。平成２４年度の各教室の授業料は以下のとおりです。
■小平・小川・東大和・立川・府中本町教室の授業料（月額）
◆小学生コース（８０分授業＋２０分の確認トレーニング）
小１～小４ 週１回12,600円～週５回52,500円
小５・小６ 週１回13,020円～週５回54,600円
中学受験 週１回14,700円～週５回63,000円
※８０分の授業で、２科目の受講も可能となっています。
◆中学生コース（８０分授業＋２０分の確認トレーニング）
中１ 週１回13,440円～週５回56,700円
中２ 週１回13,860円～週５回58,800円
中３ 週１回14,490円～週５回61,950円
◆高校生コース（８０分授業）
高１ 週１回15,540円～週５回67,200円
高２ 週１回16,170円～週５回70,350円
高３・高卒生 週１回17,220円～週５回75,600円
■清瀬・東村山教室の授業料（月額）
◆小学生コース（６０分の授業＋４０分の確認トレーニング）
小１・２ 週１回11,550円～週５回47,250円
小３・４ 週１回12,075円～週５回49,875円
小５・６ 週１回12,600円～週５回52,500円
中学受験 週１回14,175円～週５回60,375円
※６０分の授業のみのコースもあるようです。
◆中学生コース（６０分の授業＋４０分の確認トレーニング）
中１ 週１回13,125円～週５回55,125円
中２ 週１回13,650円～週５回57,750円
中３ 週１回14,700円～週５回63,000円
◆高校生コース（６０分授業）
高１ 週１回12,600円～週５回63,000円
高２ 週１回13,020円～週５回65,100円
高３・高卒生 週１回13,650円～週５回68,250円
■諸経費について（全教室共通）
入会金が12,600円、入会事務費が3,150円となっています。また月々の授業料のほかに、維持費が毎月1,575円必要です。その他、講習会の費用などが別途かかる可能性がありますので、詳細な情報につきましては各教室までお問い合わせください。
■プレ入会料金
ベスト個別指導塾では、正式に入塾する前に、指導が自分に合うかどうかを確かめるための「プレ入会」期間を設けています。約１ヶ月間、低めの料金設定で、正規入会とまったく同じ授業を受けることができるようです。
プレ入会は、以下の授業料となります。
◆全学年共通（月額）
週１回10,500円～週５回52,500円
